22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4227 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4229    100 
 
 		 793 bp  1572    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.344496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4227    100 
 
 		 793 bp  1572    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0923396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0379    87.17 
 
 		 780 bp  714    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6917    89.47 
 
 		 601 bp  581  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4165    83.98 
 
 		 841 bp  547  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  89.89 
 
 		 366 bp  432  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  89.89 
 
 		 366 bp  432  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  89.62 
 
 		 366 bp  424  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2792    89.34 
 
 		 375 bp  416  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  86.52 
 
 		 456 bp  357  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  86.52 
 
 		 456 bp  357  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  86.52 
 
 		 456 bp  357  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2793    83.81 
 
 		 444 bp  252  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6914    84 
 
 		 321 bp  196  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6145  putative IS1648 transposase  82.67 
 
 		 273 bp  123  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0246    81.86 
 
 		 261 bp  111  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0539    90.59 
 
 		 144 bp  105  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3464  hypothetical protein  92.31 
 
 		 480 bp  54  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0166666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6645    88.89 
 
 		 144 bp  50.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3940    88.89 
 
 		 228 bp  50.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114444  hitchhiker  0.00715873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  96.43 
 
 		 825 bp  48.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  91.67 
 
 		 387 bp  48.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.334321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>