25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1827 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1827  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0155623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1816  hypothetical protein  96.57 
 
 
204 aa  403  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.251111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2313  hypothetical protein  51.72 
 
 
204 aa  218  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1170  hypothetical protein  40.3 
 
 
215 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00488773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1192  zinc-finger protein  38.35 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0985672  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1161  hypothetical protein  38.31 
 
 
215 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000308056  hitchhiker  0.00693044 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1152  hypothetical protein  37.44 
 
 
222 aa  136  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0879  zinc-finger protein  38.24 
 
 
221 aa  134  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.67931  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0344  hypothetical protein  37.07 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1284  hypothetical protein  37.38 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.344133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3131  hypothetical protein  37.5 
 
 
222 aa  129  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0116  zinc-finger protein  35.47 
 
 
221 aa  118  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0461  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  111  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610551  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0861  hypothetical protein  36.88 
 
 
171 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1635  hypothetical protein  28.72 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4335  methylenetetrahydrofolate reductase  46.15 
 
 
538 aa  70.1  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359645  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1007  hypothetical protein  26.67 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000023113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0077  methylenetetrahydrofolate reductase  45.31 
 
 
523 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.026551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1782  hypothetical protein  36.36 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0302  hypothetical protein  28.57 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0915  hypothetical protein  28.23 
 
 
155 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4638  methylenetetrahydrofolate reductase domain-containing protein  32.95 
 
 
495 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4500  methylenetetrahydrofolate reductase  36.36 
 
 
495 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20901  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0801  methylenetetrahydrofolate reductase  36.36 
 
 
503 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.642261  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4632  methylenetetrahydrofolate reductase  34.85 
 
 
495 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.35154  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>