21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1623 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1623  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  273  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0247815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0497  hypothetical protein  56.58 
 
 
81 aa  87.4  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0908673  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1535  hypothetical protein  62.34 
 
 
79 aa  85.5  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.397165  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2597  hypothetical protein  54.29 
 
 
76 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.993958  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2450  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  60.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0097  hypothetical protein  39.13 
 
 
74 aa  53.9  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0436933 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3511  hypothetical protein  34.15 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0128  hypothetical protein  35.82 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1546  hypothetical protein  34.15 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2425  hypothetical protein  38.03 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0466471  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2199  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2048  hypothetical protein  40.98 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.127236  normal  0.734823 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  43.08 
 
 
366 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2179  hypothetical protein  37.7 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5111  hypothetical protein  32.31 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0184609  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0335  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.760075  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0921  NAD(+) kinase  41.94 
 
 
332 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0395  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0311  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2209  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.325426 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3045  hypothetical protein  29.33 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>