17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1198 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1198  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
509 aa  1049    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1825  beta-lactamase domain-containing protein  59.15 
 
 
505 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0395  hypothetical protein  52.5 
 
 
515 aa  559  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0936  beta-lactamase domain protein  52.31 
 
 
506 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.26189  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0909  beta-lactamase-like  43.72 
 
 
502 aa  437  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.79696  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1189  vesicle-fusing ATPase  39.41 
 
 
344 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.405449  normal  0.0544197 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0773  hypothetical protein  37.26 
 
 
367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000921775  hitchhiker  0.000000000779412 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0194  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 
528 aa  193  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00079509  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1225  hypothetical protein  25.34 
 
 
316 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.66964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  23.05 
 
 
354 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 
291 aa  47  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 
291 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  25.23 
 
 
297 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  24.24 
 
 
354 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 
322 aa  44.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 
302 aa  44.3  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  26.8 
 
 
295 aa  43.5  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>