24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2919 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2919  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  178  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.502344  hitchhiker  0.000212712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  76.83 
 
 		 262 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  41.25 
 
 		 271 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.02 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.8 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  39.02 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.51 
 
 		 257 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  35.9 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  35.9 
 
 		 258 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.89 
 
 		 258 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  32.88 
 
 		 266 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.87 
 
 		 258 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.84 
 
 		 259 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.84 
 
 		 259 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.84 
 
 		 259 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.51 
 
 		 261 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.71 
 
 		 260 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.43 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 254 aa  42  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.43 
 
 		 260 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.42 
 
 		 263 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.51 
 
 		 281 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.79 
 
 		 260 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>