11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1974 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1974    100 
 
 		 210 bp  416  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3239  transposase  98.1 
 
 		 210 bp  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.283293  normal  0.111466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2883  transposase  98.07 
 
 		 318 bp  379  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.467748  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2695  transposase  98.05 
 
 		 282 bp  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.185227  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3756  transposase  97.09 
 
 		 282 bp  361  5e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.807636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  95.12 
 
 		 405 bp  327  7e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  91.87 
 
 		 405 bp  280  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1655  transposase  91.39 
 
 		 405 bp  272  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3823    89.01 
 
 		 291 bp  101  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3048  transposase  100 
 
 		 255 bp  99.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00273884  normal  0.555878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1017  transposase  87.91 
 
 		 234 bp  93.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>