28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1110 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1110  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  724    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.506924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1140  hypothetical protein  58.5 
 
 		 348 aa  430  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1116  hypothetical protein  47.83 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0383  hypothetical protein  44.14 
 
 		 342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3172  hypothetical protein  29.61 
 
 		 304 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4421  hypothetical protein  26.67 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  0.170958 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3424  hypothetical protein  30.07 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0581  polysaccharide deacetylase  31.66 
 
 		 470 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2497  hypothetical protein  29.45 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0766  hypothetical protein  27.39 
 
 		 423 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.249559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1832  hypothetical protein  30.22 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1559  hypothetical protein  28.2 
 
 		 478 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1371  hypothetical protein  28.36 
 
 		 470 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1737  hypothetical protein  26.73 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1599  hypothetical protein  27.39 
 
 		 466 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0883  hypothetical protein  27.92 
 
 		 453 aa  88.6  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.985622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1128  hypothetical protein  23.36 
 
 		 495 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0814  hypothetical protein  23.05 
 
 		 485 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3968  hypothetical protein  23.03 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0443888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05615  hypothetical protein  22.35 
 
 		 405 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.776737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.15 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  27.95 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>