30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0801 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0801  integral membrane protein  100 
 
 		 207 aa  428  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2258  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.19 
 
 		 207 aa  221  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000178215  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0042  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.27 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.122613  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1157  integral membrane protein  40.53 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.49 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239441  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.19 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.255062  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.19 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1965  hypothetical protein  32.06 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.49 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.494463  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1555  hypothetical protein  35.5 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4504  hypothetical protein  34.34 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.4366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1080  integral membrane protein  29.08 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00417975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3487  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.24 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0723  hypothetical protein  35.42 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1725  hypothetical protein  34.38 
 
 		 234 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0776  biopolymer transport protein-like protein  31.31 
 
 		 198 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3673  biopolymer transport protein-like protein  29.8 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2684  hypothetical protein  30.26 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39630  hypothetical protein  40.45 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.854792 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0793  hypothetical protein  58.73 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3362  hypothetical protein  38.2 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00286668  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2653  hypothetical protein  35.34 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27470  hypothetical protein  44.71 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.63 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.53 
 
 		 266 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  32.65 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4004  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.65 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.894756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>