18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3600 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3600  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1995  hypothetical protein  34.02 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00112898  normal  0.836416 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  30.65 
 
 
2713 aa  73.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  30 
 
 
4791 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.19 
 
 
4220 aa  62.4  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  28.5 
 
 
2251 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  29.05 
 
 
2768 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1456  hypothetical protein  32.58 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4228  conserved repeat domain protein  29.03 
 
 
2395 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.687969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  31.76 
 
 
4214 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1886  hypothetical protein  58.54 
 
 
226 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  31.43 
 
 
5442 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0211  hypothetical protein  48 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.180901 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2686  hypothetical protein  72 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.26095  hitchhiker  0.00140271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2584  hypothetical protein  35.29 
 
 
305 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00315889  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2746  hypothetical protein  76 
 
 
336 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.675997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0590  protein of unknown function DUF1555  60.71 
 
 
235 aa  42  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.579939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  67.86 
 
 
213 aa  42  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.873186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>