18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0128 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0128  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  673    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0235  hypothetical protein  30.21 
 
 
360 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.129282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3382  hypothetical protein  32.31 
 
 
369 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000236638  normal  0.0236952 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1750  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  21.97 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1446  hypothetical protein  26.1 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.950641  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3379  hypothetical protein  25.78 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000316854  hitchhiker  0.00980308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1751  hypothetical protein  19.27 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2626  hypothetical protein  22.51 
 
 
385 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000023102  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1041  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  25.61 
 
 
262 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0398  hypothetical protein  17.01 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3207  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.82 
 
 
242 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0138209  hitchhiker  0.00000000000000265971 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1824  hypothetical protein  23.66 
 
 
186 aa  47.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.136936  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  21.74 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  21.74 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1734  hypothetical protein  25.9 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.199034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0634  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  19.53 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64483e-29 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1444  hypothetical protein  19.71 
 
 
387 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0102  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  22.67 
 
 
258 aa  43.1  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>