28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0137 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  988    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  34.74 
 
 
483 aa  232  1e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  24.44 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  22.08 
 
 
422 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  23.22 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  23.81 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  22.27 
 
 
448 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  22.89 
 
 
433 aa  57.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  28.51 
 
 
421 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  28.51 
 
 
421 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  28.51 
 
 
421 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  28.51 
 
 
421 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  28.51 
 
 
421 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 
421 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  28.05 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  28.51 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  20.13 
 
 
438 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  23.37 
 
 
425 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1682  hypothetical protein  30.39 
 
 
123 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  21.94 
 
 
440 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  23.45 
 
 
421 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  22.84 
 
 
425 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  23.18 
 
 
425 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  23.18 
 
 
425 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  23.18 
 
 
425 aa  43.5  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  22.84 
 
 
425 aa  43.1  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 
425 aa  43.5  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>