21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3007 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3007  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  229  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2467  hypothetical protein  45.13 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0625027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3647  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.13 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4881  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  54.08 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2934  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.34 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2484  hypothetical protein  40.59 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0333285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3814  hypothetical protein  32.35 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0232348  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0653  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.02 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.136342  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1647  hypothetical protein  63.64 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2566  hypothetical protein  32.17 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1820  hypothetical protein  38 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1516  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.26 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0181128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1846  hypothetical protein  34.51 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2408  hypothetical protein  33.64 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0047067  hitchhiker  0.00000146702 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2298  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.63 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2867  hypothetical protein  30.91 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2131  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.24 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1083  hypothetical protein  33.68 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0593  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.18 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.879412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1228  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2653  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.38 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0705201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>