50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02817 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02817  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 
330 aa  685    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1816  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.22 
 
 
388 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3143  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.94 
 
 
388 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220325  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3110  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.65 
 
 
399 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.12 
 
 
353 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46818  predicted protein  38.04 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19091  hypothetical protein  39.18 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0440547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3665  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  24.27 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2383  hypothetical protein  31.65 
 
 
239 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1613  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.74 
 
 
278 aa  62.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3668  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  33.03 
 
 
317 aa  62.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406515  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46074  predicted protein  33.58 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2530  hypothetical protein  31.65 
 
 
239 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3497  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.51 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5927  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0104695  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1730  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.94 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1078  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  39.76 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2982  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  31.62 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5085  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.15 
 
 
256 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193259  normal  0.545985 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35118  predicted protein  23.71 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44410  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  27.78 
 
 
255 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0878318  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1756  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  25.19 
 
 
300 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2078  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  25.19 
 
 
300 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2463  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  23.27 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2054  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  39.66 
 
 
300 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332449  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0306  hypothetical protein  31.87 
 
 
252 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.497048  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5679  putative aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.01 
 
 
309 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0866  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.27 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2028  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.15 
 
 
304 aa  47  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44380  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  34.15 
 
 
254 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2612  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25.25 
 
 
299 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5126  hypothetical protein  24.06 
 
 
299 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3076  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.62 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3524  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  24.06 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3272  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.62 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3460  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  24.06 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2063  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.62 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5906  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  30.84 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.920241  normal  0.561724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03631  aspartyl-asparaginyl beta-hydroxylase  23.31 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2921  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.48 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58550  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO1  22.83 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1877  putative aspartyl/asparaginyl BETA-hydroxylase transmembrane protein  26.83 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4681  membrane-bound beta-hydroxylase  28.57 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4548  beta-hydroxylase, aspartyl/asparaginyl family  28.57 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4541  membrane-bound beta-hydroxylase  28.57 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4632  membrane-bound beta-hydroxylase  28.57 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569284  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4632  membrane-bound beta-hydroxylase  28.57 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2038  hypothetical protein  31.46 
 
 
260 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3964  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  36.73 
 
 
298 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2423  hypothetical protein  30.49 
 
 
299 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.695409  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>