14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02011 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02011  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin i  100 
 
 		 43 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0686532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  46.51 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  48.78 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  48.78 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  42.5 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  45.24 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2106  hypothetical protein  45.24 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  56.67 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  45.24 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  39.53 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  41.46 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.53 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>