14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00945 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00945  PaaX-like protein  100 
 
 		 266 aa  548  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3911  PaaX-like  54.81 
 
 		 239 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.547243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0915  PaaX domain-containing protein  39.29 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0524  hypothetical protein  38.19 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0283  hypothetical protein  32.95 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3480  hypothetical protein  32.95 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1827  hypothetical protein  32.95 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0069  hypothetical protein  32.95 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0067  hypothetical protein  32.95 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2726  hypothetical protein  32.95 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0058  hypothetical protein  32.56 
 
 		 278 aa  164  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6140  putative transcriptional regulator, PaaX family  30.3 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.192867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5085  PaaX domain-containing protein, C- domain  23.9 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1271  PaaX domain-containing protein, C- domain  24.31 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>