96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00709 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00709  nptA protein  100 
 
 
384 aa  759    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.450079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4075  Na+/Pi-cotransporter  53.28 
 
 
386 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.799832  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00974  hypothetical protein  61.6 
 
 
356 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0208  nptA protein  61.24 
 
 
382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00499958  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004425  sodium-dependent phosphate transporter  58.13 
 
 
382 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548264  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1536  Na+/Picotransporter  55.2 
 
 
388 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1509  Na+/Picotransporter  54.67 
 
 
388 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1730  Na+/Picotransporter  55.18 
 
 
389 aa  378  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0574  sodium-dependent phosphate pump  55.92 
 
 
381 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000662533  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1607  Na+/Picotransporter  55.34 
 
 
390 aa  368  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49842  predicted protein  29.78 
 
 
571 aa  178  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1739  Na+/Pi-cotransporter  31.93 
 
 
413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.399555 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0082  Na+/Pi-cotransporter  31.96 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.241914  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33266  predicted protein  40.53 
 
 
586 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40433  predicted protein  39.67 
 
 
585 aa  137  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.150375  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47239  predicted protein  37.7 
 
 
564 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.403327  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47667  predicted protein  40.44 
 
 
606 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.12 
 
 
541 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.41 
 
 
541 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  28.21 
 
 
537 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.1 
 
 
541 aa  92  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0949  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.41 
 
 
587 aa  86.7  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506684 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.64 
 
 
549 aa  86.3  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1581  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.25 
 
 
576 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2810  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.14 
 
 
584 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.47 
 
 
548 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1146  Na/Pi cotransporter II-related  26.95 
 
 
555 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.97 
 
 
564 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47666  predicted protein  44.32 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000959743  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2825  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.01 
 
 
590 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.97 
 
 
551 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  35 
 
 
551 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  35.71 
 
 
544 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.5 
 
 
636 aa  73.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  35.77 
 
 
537 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  35 
 
 
551 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  35 
 
 
551 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  35 
 
 
551 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  35 
 
 
551 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  37.01 
 
 
551 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  37.01 
 
 
551 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  34.29 
 
 
551 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.85 
 
 
551 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000310197  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.59 
 
 
539 aa  67.8  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0064  Na+/Pi-cotransporter  41.9 
 
 
586 aa  67.4  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1565  Na+/phosphate symporter  38.64 
 
 
562 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9722500000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0096  Na/Pi-cotransporter II-related protein  44.05 
 
 
555 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1777  Na/Pi cotransporter II-related  43.02 
 
 
600 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790059  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0064  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.86 
 
 
318 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30 
 
 
541 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2431  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.65 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816248  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  44.05 
 
 
555 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.54 
 
 
538 aa  64.3  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1191  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.45 
 
 
570 aa  63.5  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.33 
 
 
556 aa  63.5  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.46 
 
 
554 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  43.53 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.138748  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  42 
 
 
564 aa  61.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.2 
 
 
643 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4094  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.26 
 
 
304 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.890798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0173  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.16 
 
 
559 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00842075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2560  Na+/phosphate symporter  31.11 
 
 
557 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.46827e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1695  Na+/Picotransporter  25.67 
 
 
571 aa  57  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.483825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08740  Na-cotransporter  40.96 
 
 
308 aa  56.6  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1891  Na+/Pi-cotransporter  25.67 
 
 
571 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.764459  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.81 
 
 
536 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1019  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.35 
 
 
311 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  38.14 
 
 
559 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1044  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.84 
 
 
574 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.95 
 
 
565 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.67 
 
 
567 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  22.08 
 
 
535 aa  53.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0079  Na+/Pi-cotransporter  42.31 
 
 
592 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0444  hypothetical protein  24.83 
 
 
559 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.03 
 
 
558 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1943  Na+/Pi-cotransporter  30.23 
 
 
584 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0199  Na+/Picotransporter  38.82 
 
 
303 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2947  Na+/Picotransporter  39 
 
 
548 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1318  Na+/Pi-cotransporter  30.08 
 
 
534 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.33 
 
 
556 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000135688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2859  Na+/H+ antiporter  36.96 
 
 
554 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.239008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1114  Na+/Pi-cotransporter  41.89 
 
 
566 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.62 
 
 
556 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0476  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.33 
 
 
586 aa  47  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0543  Na+/Pi-cotransporter  35.16 
 
 
616 aa  46.6  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0595  hypothetical protein  29.41 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.61 
 
 
566 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3663  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.12 
 
 
535 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  31.48 
 
 
548 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1876  Na+/Pi-cotransporter  38.16 
 
 
289 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00688097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2528  Na+/H+ antiporter  31.86 
 
 
549 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1050  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.8 
 
 
594 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1964  Na/Pi cotransporter family protein  31.96 
 
 
549 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0226  Na+/Pi-cotransporter  34.67 
 
 
608 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654471  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.29 
 
 
563 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1721  Na+/Pi-cotransporter  33.71 
 
 
539 aa  42.7  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24313  hitchhiker  0.00000570659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>