99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4075 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4075  Na+/Pi-cotransporter  100 
 
 		 386 aa  745    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.799832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1607  Na+/Picotransporter  59.18 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00709  nptA protein  53.28 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.450079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1730  Na+/Picotransporter  57.99 
 
 		 389 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0208  nptA protein  55.4 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00499958  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00974  hypothetical protein  54.15 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004425  sodium-dependent phosphate transporter  51.87 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548264  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0574  sodium-dependent phosphate pump  52.7 
 
 		 381 aa  354  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000662533  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1536  Na+/Picotransporter  48.78 
 
 		 388 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1509  Na+/Picotransporter  48.91 
 
 		 388 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47239  predicted protein  33.98 
 
 		 564 aa  190  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.403327  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0082  Na+/Pi-cotransporter  35.79 
 
 		 400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.241914  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1739  Na+/Pi-cotransporter  33.68 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399555 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40433  predicted protein  41.54 
 
 		 585 aa  140  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.150375  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33266  predicted protein  45.56 
 
 		 586 aa  132  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47667  predicted protein  50.79 
 
 		 606 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49842  predicted protein  44.52 
 
 		 571 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2810  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.36 
 
 		 584 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.11 
 
 		 548 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47666  predicted protein  32.73 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000959743  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.32 
 
 		 549 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  26.73 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1581  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.19 
 
 		 576 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393232  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.19 
 
 		 541 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  43.3 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  43.3 
 
 		 551 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  43.3 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  43.3 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000310197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  43.3 
 
 		 551 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  43.3 
 
 		 551 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  43.3 
 
 		 544 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  43.3 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  43.3 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  43.3 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  43.3 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.88 
 
 		 556 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1777  Na/Pi cotransporter II-related  41.88 
 
 		 600 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  25.76 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0096  Na/Pi-cotransporter II-related protein  44.44 
 
 		 555 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  44.44 
 
 		 555 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.4 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1964  Na/Pi cotransporter family protein  29.47 
 
 		 549 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2859  Na+/H+ antiporter  28.85 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  45.45 
 
 		 636 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.39 
 
 		 541 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1565  Na+/phosphate symporter  36.11 
 
 		 562 aa  67  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9722500000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.41 
 
 		 541 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0064  Na+/Pi-cotransporter  40.86 
 
 		 586 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0173  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.89 
 
 		 559 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00842075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4094  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.83 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.890798  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.2 
 
 		 538 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1146  Na/Pi cotransporter II-related  38.71 
 
 		 555 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2825  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.08 
 
 		 590 aa  63.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0064  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.66 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  42.68 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.3 
 
 		 643 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.78 
 
 		 564 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.37 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  36.73 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.79 
 
 		 564 aa  60.8  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0079  Na+/Pi-cotransporter  29.52 
 
 		 592 aa  60.1  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08740  Na-cotransporter  33.79 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.55 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1191  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.67 
 
 		 570 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.56 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000135688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.27 
 
 		 565 aa  58.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.06 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.138748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.67 
 
 		 536 aa  56.6  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2431  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.24 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816248  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0476  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.78 
 
 		 586 aa  56.2  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1114  Na+/Pi-cotransporter  34.78 
 
 		 566 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1019  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.37 
 
 		 311 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2560  Na+/phosphate symporter  34.44 
 
 		 557 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.46827e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1044  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.77 
 
 		 574 aa  54.3  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0949  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.19 
 
 		 587 aa  53.9  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000506684 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0199  Na+/Picotransporter  39.53 
 
 		 303 aa  53.1  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0461  Na+/Pi-cotransporter  47.5 
 
 		 554 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.790471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0444  hypothetical protein  29.24 
 
 		 559 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1695  Na+/Picotransporter  27.36 
 
 		 571 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.483825  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1891  Na+/Pi-cotransporter  27.36 
 
 		 571 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.764459  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1876  Na+/Pi-cotransporter  43.24 
 
 		 289 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00688097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1050  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.27 
 
 		 594 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2510  Na+/H+ antiporter  40.48 
 
 		 572 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.437646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2947  Na+/Picotransporter  39.29 
 
 		 548 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.46 
 
 		 567 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0595  hypothetical protein  22.22 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.09 
 
 		 563 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2528  Na+/H+ antiporter  39.36 
 
 		 549 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.79 
 
 		 566 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3663  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.25 
 
 		 535 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0962  Na+/Pi-cotransporter  31.75 
 
 		 578 aa  47  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.126514  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  32.22 
 
 		 535 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0226  Na+/Pi-cotransporter  35.43 
 
 		 608 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4194  Na+/Pi-cotransporter  31.03 
 
 		 613 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1907  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.62 
 
 		 556 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0543  Na+/Pi-cotransporter  33.7 
 
 		 616 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.96 
 
 		 556 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1721  Na+/Pi-cotransporter  33.66 
 
 		 539 aa  43.5  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24313  hitchhiker  0.00000570659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.48 
 
 		 562 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>