18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2699 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2699  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  424  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3265  hypothetical protein  69.87 
 
 
229 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1957  hypothetical protein  50.69 
 
 
219 aa  184  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0559191  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2920  hypothetical protein  54.79 
 
 
228 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2233  hypothetical protein  50 
 
 
219 aa  174  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.294656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1912  hypothetical protein  53.49 
 
 
219 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3125  hypothetical protein  39.91 
 
 
214 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0839  hypothetical protein  42.04 
 
 
220 aa  118  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2787  hypothetical protein  37.96 
 
 
221 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2228  hypothetical protein  39.45 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0631  hypothetical protein  36.84 
 
 
214 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000769552  normal  0.221346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0028  hypothetical protein  31.78 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.29937  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6222  hypothetical protein  45.05 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308701  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0943  hypothetical protein  46.57 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.056929  normal  0.547574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2387  hypothetical protein  33.85 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0136297  normal  0.0170325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1687  hypothetical protein  39.19 
 
 
172 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1755  hypothetical protein  39.19 
 
 
172 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635154  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1710  hypothetical protein  39.19 
 
 
172 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>