26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2096 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2096  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  282  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0697301  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1064  hypothetical protein  87.5 
 
 
144 aa  191  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.589479  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3985  hypothetical protein  64.96 
 
 
162 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  decreased coverage  0.00103127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4818  hypothetical protein  65.89 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  0.143523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4669  hypothetical protein  63.45 
 
 
149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4300  hypothetical protein  73.2 
 
 
151 aa  157  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0715  hypothetical protein  48.85 
 
 
214 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1127  hypothetical protein  41.54 
 
 
129 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  0.694402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1016  hypothetical protein  43.07 
 
 
148 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.586424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1260  hypothetical protein  44.76 
 
 
125 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4016  hypothetical protein  43.81 
 
 
125 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1168  hypothetical protein  38.78 
 
 
140 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4328  hypothetical protein  43.81 
 
 
125 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2380  hypothetical protein  45 
 
 
146 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.37673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1477  hypothetical protein  42.98 
 
 
146 aa  98.6  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1242  hypothetical protein  44 
 
 
129 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2615  hypothetical protein  44.34 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0733143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1090  hypothetical protein  45.65 
 
 
229 aa  93.6  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0962  hypothetical protein  43.56 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2701  hypothetical protein  39.05 
 
 
163 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0364226  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0671  hypothetical protein  41.51 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0665  hypothetical protein  41.51 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0709  putative signal peptide protein  42.57 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1465  hypothetical protein  39.45 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0757  hypothetical protein  28.41 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0823  hypothetical protein  33.87 
 
 
162 aa  43.5  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32462  hitchhiker  0.000215418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>