17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0685 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0685  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 102 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.419495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1491  Cupin 2 conserved barrel domain protein  91.18 
 
 		 102 aa  194  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3900  cupin 2 domain-containing protein  79.41 
 
 		 108 aa  174  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.487212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0412  hypothetical protein  49.44 
 
 		 94 aa  93.6  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4250  hypothetical protein  49.41 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.41432  normal  0.497138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1128  hypothetical protein  42.71 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1619  hypothetical protein  48.89 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01610  hypothetical protein  49.44 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522727  normal  0.697897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0207  hypothetical protein  48.31 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7511  hypothetical protein  46.59 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2708  cupin 2 protein  46.43 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1440  hypothetical protein  46.88 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1420  cupin 2, barrel  46.81 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.809174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4658  hypothetical protein  41.94 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3964  cupin 2, barrel  43.68 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0415147  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0764  hypothetical protein  41.18 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6852  hypothetical protein  47.95 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.286237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>