19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0195 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0195  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  781    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0748  hypothetical protein  23.12 
 
 
897 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0745  hypothetical protein  26.35 
 
 
435 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.570751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3297  WcbF  25.6 
 
 
498 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1346  hypothetical protein  25.32 
 
 
681 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3249  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 
427 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3284  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 
427 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1634  hypothetical protein  22.41 
 
 
265 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2136  hypothetical protein  22.41 
 
 
265 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1410  hypothetical protein  22.41 
 
 
265 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3178  hypothetical protein  22.41 
 
 
265 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2662  hypothetical protein  22.41 
 
 
265 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0658  hypothetical protein  31.78 
 
 
519 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  0.0369536 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2574  hypothetical protein  21.99 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2521  hypothetical protein  21.99 
 
 
265 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1073  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.110982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2180  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0526  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615535  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4150  hypothetical protein  29.67 
 
 
267 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.287277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>