14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1964 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1964  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  236  9e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2325  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  236  9e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.142274  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0532  hypothetical protein  33.67 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094496  unclonable  0.000000000020236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0362  hypothetical protein  33.67 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  29.59 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2893  hypothetical protein  28.74 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000100997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  29 
 
 		 114 aa  47.4  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2920  hypothetical protein  28 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2987  hypothetical protein  32.94 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  30.43 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  30 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1167  hypothetical protein  23.53 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2402  hypothetical protein  25.88 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000157501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1722  hypothetical protein  31.03 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>