22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1568 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1568  hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  98.2  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.652462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1441  hemin transport system, hemin uptake protein  59.52 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3017  hemin transport system, hemin uptake protein  52.08 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3268  hemin transport system, hemin uptake protein  51.02 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202913  hitchhiker  0.00689409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2337  hemin uptake protein-like protein  58.33 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0725  hypothetical protein  55.56 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.681325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4165  hypothetical protein  47.73 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3314  hypothetical protein  48.84 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  0.549861 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0386  hypothetical protein  55.26 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0186  hypothetical protein  51.11 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20305 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3132  hypothetical protein  54.05 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1804  hypothetical protein  51.28 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1605  hypothetical protein  47.73 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000330162  hitchhiker  0.0000142519 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0444  Hemin uptake protein hemP  48.78 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.0000183054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04672  hypothetical protein  47.06 
 
 		 74 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1687  hypothetical protein  45.24 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2351  hypothetical protein  54.05 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.346428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1117  hypothetical protein  45.65 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.180887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1439  hypothetical protein  55.56 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2409  hypothetical protein  55.56 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.472359  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1508  hypothetical protein  45.24 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.265609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3622  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>