30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1567 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1567  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  700    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1287  hypothetical protein  33.54 
 
 
322 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1655  hypothetical protein  29.55 
 
 
345 aa  125  8.000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.965498  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0408  YbbR family protein  32.03 
 
 
299 aa  125  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000779718  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  29.32 
 
 
412 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  27.08 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0150  YbbR family protein  26.35 
 
 
503 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0149  YbbR family protein  26.65 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.948785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0149  hypothetical protein  25.43 
 
 
493 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5136  hypothetical protein  24.23 
 
 
495 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0200  hypothetical protein  25.14 
 
 
495 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0179  hypothetical protein  25.14 
 
 
493 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0151  hypothetical protein  25.14 
 
 
493 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0156  hypothetical protein  25.14 
 
 
496 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0157  hypothetical protein  25.14 
 
 
496 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0188  hypothetical protein  24.85 
 
 
493 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.315726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0156  hypothetical protein  24.78 
 
 
495 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2194  hypothetical protein  23.05 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2232  hypothetical protein  23.05 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  26.91 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1231  hypothetical protein  22.46 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0478  hypothetical protein  23.69 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.808143  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0886  hypothetical protein  23.79 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1763  hypothetical protein  23.05 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  23.82 
 
 
401 aa  60.1  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  23.64 
 
 
311 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  26.45 
 
 
437 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2640  hypothetical protein  28.57 
 
 
471 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.911515  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1819  YbbR family protein  30.77 
 
 
239 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  24.14 
 
 
334 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>