16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0934 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0934  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0737095  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  31.09 
 
 
100 aa  52.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2212  hypothetical protein  29.25 
 
 
183 aa  50.4  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00418947  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  29.03 
 
 
123 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  27.83 
 
 
106 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  30.89 
 
 
116 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  27.96 
 
 
126 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  29.03 
 
 
126 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0196  hypothetical protein  29.36 
 
 
159 aa  46.2  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.667333  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  33.33 
 
 
137 aa  46.2  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0933  hypothetical protein  25.98 
 
 
173 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00253328  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0275  hypothetical protein  26.62 
 
 
146 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.560646  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  27.61 
 
 
120 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  21.99 
 
 
156 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  30.43 
 
 
174 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  27.82 
 
 
166 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>