13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23100 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_23100  predicted membrane protein  100 
 
 
166 aa  319  9.000000000000001e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.121843  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4112  putative integral membrane protein  46.9 
 
 
163 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2903  membrane protein-like protein  40.61 
 
 
169 aa  92  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.459187  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2612  membrane protein-like protein  40.56 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00392966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03690  predicted membrane protein  43.8 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2971  hypothetical protein  42.86 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0066  hypothetical protein  34.95 
 
 
128 aa  55.1  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0224  hypothetical protein  38.46 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.983622  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2110  membrane protein-like protein  45.21 
 
 
178 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0164736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1254  membrane protein-like  31.75 
 
 
172 aa  44.3  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.336737 
 
 
-
 
NC_004310  BR1486  hypothetical protein  34.65 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1441  hypothetical protein  34.65 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3407  hypothetical protein  27.59 
 
 
128 aa  40.8  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>