17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10780 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_10780  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  321  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.727919  normal  0.390752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2250  secreted protein  44.03 
 
 
167 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000517374 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2513  secreted protein  40.48 
 
 
167 aa  88.2  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197512  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1596  hypothetical protein  38.89 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0390754  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2309  hypothetical protein  41.54 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000375151  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18490  hypothetical protein  42.86 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08800  hypothetical protein  35.58 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125431  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11170  hypothetical protein  36.43 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0582043  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1679  hypothetical protein  36.51 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0785238  hitchhiker  0.00456336 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2284  hypothetical protein  34.84 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0855432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1365  secreted protein  36.67 
 
 
171 aa  54.3  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866634  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1163  hypothetical protein  34.19 
 
 
224 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.000000032705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0202  hypothetical protein  34.13 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1129  hypothetical protein  30.37 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3290  hypothetical protein  32.74 
 
 
174 aa  44.7  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3445  hypothetical protein  37.18 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.815991  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0641  hypothetical protein  31.25 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>