13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05140 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_05140  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
264 aa  533  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0662  hypothetical protein  43.68 
 
 
278 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3085  hypothetical protein  44.73 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0604  hypothetical protein  43.37 
 
 
263 aa  195  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00834327  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4168  hypothetical protein  35.71 
 
 
286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  34.55 
 
 
663 aa  116  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  34.08 
 
 
664 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  32.88 
 
 
664 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  29.74 
 
 
663 aa  89.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11003  hypothetical protein  31.08 
 
 
276 aa  86.3  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0721852  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  25.75 
 
 
656 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4905  hypothetical protein  54.72 
 
 
62 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38069  normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  23.46 
 
 
672 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>