More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4637 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009806  Krad_4637  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
337 aa  672    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4519  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 
313 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4544  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.22 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.89 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.704382  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3120  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.8 
 
 
307 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136524  normal  0.126924 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5582  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.73 
 
 
309 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.08 
 
 
309 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.17 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.94 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.95 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.13 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.08 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  31.77 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.12 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.17 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3517  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.28 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.86 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  22.3 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.83 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.27 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  27.69 
 
 
262 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.65 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.74 
 
 
270 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.96 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  34.27 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.48 
 
 
262 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.18 
 
 
262 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0047  replication-associated protein  24.6 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  25.74 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.11 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.1 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  28.67 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  27.69 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  27.69 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  28.1 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0871  ParA family protein  29.31 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.401351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.21 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.64 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.64 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  31.64 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.21 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.64 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  26.34 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.64 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.64 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.64 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.64 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  31.64 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0040  ParaA family ATPase  24.6 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00514136  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  27.27 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.55 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.61 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  29.57 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.45 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  29.73 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.44 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.44 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  26.89 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  36.31 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1176  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.19 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291287  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.51 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.96 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5392  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.9 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.28494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.83 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
262 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  26.77 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.69 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.52 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  31.69 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.09 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  25.28 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.45 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.95 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.61 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  26.62 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.25 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  27.94 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.61 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.32 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  24.81 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  32.56 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.99 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.89 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  23.99 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.18 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  35.62 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.44 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  28.64 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>