32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4303 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4303  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  424  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0361171  normal  0.12147 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01720  hypothetical protein  50.68 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0473  hypothetical protein  49.54 
 
 
212 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1359  hypothetical protein  46.76 
 
 
212 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000393544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1316  hypothetical protein  46.73 
 
 
210 aa  190  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06030  hypothetical protein  44.91 
 
 
216 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5302  hypothetical protein  43.32 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  30.22 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3052  hypothetical protein  29.59 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.140554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3068  hypothetical protein  25 
 
 
265 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3101  hypothetical protein  25.41 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3278  hypothetical protein  29.23 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1151  hypothetical protein  26.46 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2180  hypothetical protein  26.26 
 
 
265 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89503  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  29.26 
 
 
229 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  30.89 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  29.44 
 
 
225 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3098  hypothetical protein  24.31 
 
 
265 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2048  hypothetical protein  26.03 
 
 
267 aa  45.1  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.128693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  26.67 
 
 
246 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3082  hypothetical protein  23.98 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  29.76 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  35.05 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2832  hypothetical protein  23.98 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  29.57 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3073  hypothetical protein  23.98 
 
 
265 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.586604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2860  hypothetical protein  23.98 
 
 
265 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  28.93 
 
 
231 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2853  hypothetical protein  23.32 
 
 
265 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0417  hypothetical protein  26.23 
 
 
311 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2792  hypothetical protein  24.62 
 
 
265 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  28.64 
 
 
256 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>