50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4227 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
324 aa  626  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  42.02 
 
 
261 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  45.67 
 
 
265 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  41.25 
 
 
262 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  38.91 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  46.43 
 
 
256 aa  192  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4777  aminoglycoside phosphotransferase  45.71 
 
 
281 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1031  trifolitoxin immunity protein  34.47 
 
 
263 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1028  trifolitoxin immunity protein  34.47 
 
 
263 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  34.35 
 
 
263 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1133  trifolitoxin immunity domain-containing protein  34.23 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000583619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1053  trifolitoxin immunity domain-containing protein  34.23 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000137711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  33.97 
 
 
263 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3328  aminoglycoside phosphotransferase  33.59 
 
 
264 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4156  trifolitoxin immunity protein  33.71 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000289256  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1183  trifolitoxin immunity protein  34.09 
 
 
263 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  40.55 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  37.65 
 
 
247 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  40.65 
 
 
238 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  38.87 
 
 
295 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  52.98 
 
 
219 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1068  aminoglycoside phosphotransferase  39.04 
 
 
252 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0761  aminoglycoside phosphotransferase  38.98 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230447  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0079  aminoglycoside phosphotransferase  35.41 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  35.83 
 
 
279 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2954  aminoglycoside phosphotransferase  43.39 
 
 
255 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00316699  decreased coverage  0.00012693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7402  hypothetical protein  40.53 
 
 
266 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2798  aminoglycoside phosphotransferase  36.89 
 
 
264 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  39.62 
 
 
257 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2262  aminoglycoside phosphotransferase  36.26 
 
 
253 aa  99.8  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1734  aminoglycoside phosphotransferase  42 
 
 
283 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  33.19 
 
 
268 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1421  putative trifolitoxin immunity protein  35.43 
 
 
254 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  32.67 
 
 
251 aa  93.2  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35590  phosphotransferase family protein  32.56 
 
 
269 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.886492  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  33.59 
 
 
277 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1013  aminoglycoside phosphotransferase  37.25 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1395  putative trifolitoxin immunity protein  35.8 
 
 
243 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.815075  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1984  putative TfxG-like immunity protein against TfxA-like peptides  37.11 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2772  aminoglycoside phosphotransferase  31.94 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1212  trifolitoxin immunity protein  36.43 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  28.74 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2966  aminoglycoside phosphotransferase  31.18 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14970  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  29.06 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.448489  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13550  aminoglycoside phosphotransferase  43.24 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.669259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  31.96 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  29.81 
 
 
355 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  29.9 
 
 
355 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0449  aminoglycoside phosphotransferase  47.22 
 
 
351 aa  42.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  29.9 
 
 
355 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>