24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3840 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3840  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  118  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739989  normal  0.0432381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  42.59 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  44.83 
 
 		 58 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3239  hypothetical protein  46.81 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.641232  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  43.86 
 
 		 57 aa  44.3  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  43.86 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09130  hypothetical protein  47.37 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  37.74 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1855  protein of unknown function DUF343  43.86 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.176655  hitchhiker  0.00737468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  35.29 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  35.29 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1218  hypothetical protein  49.12 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.995258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  35.29 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  35.29 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  37.25 
 
 		 61 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  37.25 
 
 		 61 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  35.29 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  30.19 
 
 		 56 aa  41.2  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3156  hypothetical protein  43.14 
 
 		 60 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.733102  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  30.19 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  35.85 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2153  hypothetical protein  39.22 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.286356  normal  0.313374 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1772  hypothetical protein  35.85 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5857  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768237  normal  0.140959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>