16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1652 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1652  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  100 
 
 
259 aa  494  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257969  normal  0.368301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0843  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  35.29 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0976  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  37.43 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  33.5 
 
 
227 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  32.14 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  32.14 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2345  flagellar assembly protein FliH  32.47 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  29.85 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  27.23 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  29 
 
 
231 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  31.29 
 
 
257 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  32.14 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  28.57 
 
 
238 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0705  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  23.11 
 
 
236 aa  42.7  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  22.61 
 
 
249 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  31.43 
 
 
247 aa  42  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.222897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>