More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0871 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0871  phosphate transporter  100 
 
 
330 aa  630  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  70.06 
 
 
334 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  65.41 
 
 
385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  67.72 
 
 
332 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  66.97 
 
 
333 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3421  phosphate transporter  67.66 
 
 
337 aa  391  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0300  phosphate transporter  69.62 
 
 
332 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.942291  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2817  phosphate transporter  69.44 
 
 
334 aa  381  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.011171 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33540  phosphate/sulfate permease  69.94 
 
 
334 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0469788  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0740  phosphate transporter  61.3 
 
 
336 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0241  phosphate transporter  62.38 
 
 
334 aa  374  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2027  phosphate transporter  61.66 
 
 
333 aa  363  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0326  phosphate transporter  60.43 
 
 
334 aa  355  5e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0283  phosphate transporter  60.9 
 
 
334 aa  343  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0849813 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  51.99 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  53.87 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  53.14 
 
 
336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  54.37 
 
 
337 aa  302  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2744  phosphate transport protein  50.32 
 
 
331 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0588425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0563  phosphate transporter family protein  49.85 
 
 
332 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0549  phosphate permease  49.85 
 
 
332 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  53.12 
 
 
333 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  52.24 
 
 
332 aa  299  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  49.55 
 
 
329 aa  298  6e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  50.91 
 
 
333 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  52.74 
 
 
370 aa  297  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2658  phosphate transporter  50.15 
 
 
332 aa  295  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  49.85 
 
 
332 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  49.55 
 
 
333 aa  292  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  48.06 
 
 
333 aa  291  9e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5168  phosphate transporter  53.19 
 
 
336 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0592  phosphate transporter  53.19 
 
 
336 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  52.63 
 
 
333 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1777  phosphate transporter  52.58 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1805  phosphate transporter  52.58 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1406  phosphate transporter  52.89 
 
 
336 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.596183  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1960  phosphate transporter  57.24 
 
 
334 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3021  phosphate transporter  48.94 
 
 
332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3585  phosphate transporter  48.47 
 
 
333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  47.48 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6211  phosphate transporter  53.53 
 
 
336 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450178  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1891  phosphate transporter  53.53 
 
 
336 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123921  hitchhiker  0.0000000789991 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1868  phosphate transporter  53.53 
 
 
336 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2876  phosphate transporter  47.89 
 
 
332 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  51.99 
 
 
336 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  50.47 
 
 
338 aa  279  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  47.15 
 
 
335 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  49.54 
 
 
326 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2626  phosphate transporter  49.84 
 
 
327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2284  phosphate transporter family protein  51.94 
 
 
336 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1398  phosphate transporter family protein  51.94 
 
 
336 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2410  phosphate transporter family protein  51.94 
 
 
354 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2245  phosphate transporter family protein  51.94 
 
 
336 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1161  phosphate transporter family protein  51.94 
 
 
336 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1888  phosphate transporter family protein  51.94 
 
 
336 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.527303  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0008  phosphate transporter family protein  51.94 
 
 
336 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0756499  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2185  phosphate transporter family protein  51.94 
 
 
354 aa  271  9e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0043  phosphate transporter  49.52 
 
 
331 aa  270  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  49.85 
 
 
336 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1973  phosphate transporter  49.69 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137015  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0317  phosphate transporter family protein  45.95 
 
 
336 aa  268  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.178517  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  51.45 
 
 
336 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  51.45 
 
 
336 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  47.06 
 
 
335 aa  268  8e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  47.06 
 
 
335 aa  268  8e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  51.11 
 
 
336 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  50.89 
 
 
336 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10556  low affinity inorganic phosphate transporter integral membrane protein pitA  48.79 
 
 
417 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0205313  normal  0.167951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  50.48 
 
 
336 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1143  phosphate transporter  48.89 
 
 
380 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.639626  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0917  phosphate transporter  51.77 
 
 
336 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  normal  0.295731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2000  phosphate transporter  49.85 
 
 
335 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1687  phosphate transporter  51.58 
 
 
336 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2552  phosphate transporter  49.39 
 
 
354 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.729981  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1083  phosphate transporter  50.31 
 
 
336 aa  262  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  52.05 
 
 
336 aa  262  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  52.05 
 
 
336 aa  262  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1576  phosphate transporter family protein  47.09 
 
 
332 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000371851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1361  phosphate transporter family protein  47.09 
 
 
332 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000679914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1335  phosphate transporter  47.09 
 
 
332 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000375914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1334  phosphate transporter  47.09 
 
 
332 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000421375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1471  phosphate transporter family protein  47.09 
 
 
332 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.466845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2499  phosphate transporter  48.95 
 
 
346 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.617445  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1614  phosphate transporter family protein  47.09 
 
 
332 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000923139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1545  phosphate transporter family protein  47.09 
 
 
332 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000352137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5449  phosphate transporter  49.07 
 
 
386 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0370554  normal  0.318098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  49.06 
 
 
335 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0911  phosphate transporter  51.83 
 
 
378 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3837  phosphate transporter family protein  47.52 
 
 
332 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0211808  hitchhiker  0.000000000133014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2395  phosphate transporter  50.76 
 
 
336 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38618  normal  0.093565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2335  phosphate transporter  51.67 
 
 
336 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1508  phosphate transporter family protein  47.52 
 
 
332 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0297003  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2217  phosphate transporter  45.45 
 
 
427 aa  258  8e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1178  phosphate transporter  47.68 
 
 
332 aa  258  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010062  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3393  phosphate transporter  49.1 
 
 
334 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1376  phosphate transporter  45.43 
 
 
332 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000403006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0678  phosphate transporter  50.15 
 
 
336 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1443  phosphate transporter  43.82 
 
 
373 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315159  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1152  phosphate transporter  50.46 
 
 
336 aa  256  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3131  phosphate transporter  50.15 
 
 
345 aa  255  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150684  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>