13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3559 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3559  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  569  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4178  hypothetical protein  30.28 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.822736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  27.8 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2258  hypothetical protein  26.97 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  26.09 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2211  hypothetical protein  28.99 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  25.61 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  26.69 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  45.83 
 
 		 272 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  48.84 
 
 		 405 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  24.55 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  23.21 
 
 		 241 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  26.12 
 
 		 359 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>