21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2211 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2211  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  751    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  31.06 
 
 
369 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  26.13 
 
 
268 aa  93.6  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  31.06 
 
 
369 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  30.06 
 
 
359 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  28.02 
 
 
335 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  28.99 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3559  hypothetical protein  28.57 
 
 
287 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  25.38 
 
 
260 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  41.46 
 
 
250 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4178  hypothetical protein  37.39 
 
 
252 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.822736  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4200  hypothetical protein  33.66 
 
 
281 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00749597  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3879  hypothetical protein  23.84 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3899  putative nutrient deprivation-induced protein  29.67 
 
 
321 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  36.84 
 
 
332 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  29.52 
 
 
272 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  35.29 
 
 
232 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  26.97 
 
 
241 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  21.4 
 
 
329 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1436  hypothetical protein  26 
 
 
395 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.050652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>