13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1254 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1254  membrane protein-like  100 
 
 		 172 aa  345  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.336737 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1441  hypothetical protein  38.51 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1486  hypothetical protein  38.51 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2971  hypothetical protein  40.6 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2110  membrane protein-like protein  44.78 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0164736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0224  hypothetical protein  41.73 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.983622  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4112  putative integral membrane protein  34.81 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0066  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3407  hypothetical protein  31.9 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2265  membrane protein-like protein  32.54 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953677  normal  0.0891239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2903  membrane protein-like protein  33.11 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.459187  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03690  predicted membrane protein  35.23 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23100  predicted membrane protein  31.75 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.121843  normal  0.492875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>