20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0504 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0504  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  281  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0184  hypothetical protein  54.05 
 
 
150 aa  123  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.22231  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1664  hypothetical protein  52.74 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2581  hypothetical protein  51.68 
 
 
150 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453337 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0297  hypothetical protein  52.05 
 
 
150 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2571  hypothetical protein  45.95 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00137712  unclonable  0.0000000326154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3352  hypothetical protein  40.44 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  37.41 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  28.93 
 
 
469 aa  59.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  33.75 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  33.56 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0532  hypothetical protein  32.88 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.790547 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  32.39 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  28.49 
 
 
309 aa  44.7  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  35.14 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  33.09 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3156  hypothetical protein  38.81 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3480  hypothetical protein  38.81 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0151  hypothetical protein  31.33 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>