12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2456 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2456  transcriptional regulator TrmB  100 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.189668  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2775  transcriptional regulator TrmB  41.28 
 
 		 197 aa  131  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2669  transcriptional regulator, TrmB  38.64 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4529  transcriptional regulator TrmB  36.88 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1666  transcriptional regulator, TrmB  35.39 
 
 		 225 aa  94.4  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3263  transcriptional regulator, TrmB  33.12 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3623  hypothetical protein  29.14 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1078  transcriptional regulator, TrmB  29.14 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0157  hypothetical protein  29.45 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1057  transcriptional regulator, TrmB  27.07 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.607328  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3508  hypothetical protein  35.71 
 
 		 98 aa  50.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3563  hypothetical protein  35.71 
 
 		 98 aa  50.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>