20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2184 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2184  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.573251  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0890  polysaccharide deacetylase  53 
 
 		 286 aa  296  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.175163  normal  0.871728 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2868  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 		 338 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3271  polysaccharide deacetylase  32.06 
 
 		 367 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3562  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4606  hypothetical protein  28.98 
 
 		 246 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  31.88 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  31.88 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  39.73 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  40.58 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  40.58 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  40.58 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  40.58 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4617  polysaccharide deacetylase  37.68 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  37.68 
 
 		 348 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  30.49 
 
 		 391 aa  42.4  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>