12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1288 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1288  hypothetical protein  100 
 
 
1195 aa  2374    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1215  metallophosphoesterase  29.22 
 
 
359 aa  53.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396235  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0818  metallophosphoesterase  29.38 
 
 
357 aa  52.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  20.5 
 
 
871 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1083  metallophosphoesterase  23.59 
 
 
314 aa  50.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0304691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3682  hypothetical protein  29.71 
 
 
449 aa  48.5  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0931  hypothetical protein  27.15 
 
 
357 aa  47.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.101204 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2423  hypothetical protein  27.54 
 
 
296 aa  46.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0294775  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1690  hypothetical protein  26.85 
 
 
367 aa  45.8  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0381048  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1170  hypothetical protein  27.52 
 
 
387 aa  45.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7579  hypothetical protein  21.68 
 
 
487 aa  45.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.683042  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  23.12 
 
 
1543 aa  44.7  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>