15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1241 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1241  DoxX family protein  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0083  DoxX family protein  33.16 
 
 
184 aa  89  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0953  DoxX family protein  31.09 
 
 
185 aa  84.7  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.661535  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1027  DoxX family protein  35.2 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.662698 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3491  DoxX family protein  29.59 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2462  DoxX family protein  34.88 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.984431  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0371  DoxX family protein  34.3 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167599  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1903  DoxX family protein  34.52 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.244663  normal  0.193783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6943  DoxX family protein  38.55 
 
 
201 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2102  DoxX family protein  26.27 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132413  normal  0.296398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2245  DoxX family protein  28.41 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0747562  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0502  hypothetical protein  35.23 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10640  DoxX protein  35.37 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0732523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4739  DoxX family protein  30.67 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3522  hypothetical protein  29.81 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>