14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1941 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1941  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
166 aa  342  2e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  71.08 
 
 
161 aa  237  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.21 
 
 
162 aa  201  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0993082  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1117  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.34 
 
 
159 aa  120  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136519  normal  0.299442 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3399  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.04 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1346  hypothetical protein  34.78 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.956224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0118  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.2 
 
 
125 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 
141 aa  54.3  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2709  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.98 
 
 
126 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.11 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 
122 aa  48.5  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1227  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.3 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.718162  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  35.56 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  31.96 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>