17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_12470 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_12470  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  240  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1347  ubiquitin-associated domain-containing protein  44.72 
 
 
136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000690799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0602  hypothetical protein  40.62 
 
 
144 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3049  hypothetical protein  39.02 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0255915  normal  0.0152403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2474  hypothetical protein  38.58 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000687328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1536  ubiquitin-associated domain-containing protein  33.04 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.450314  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3056  ubiquitin-associated- domain-containing protein  31.93 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.275328  hitchhiker  0.00000312149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3243  hypothetical protein  37.33 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal  0.545976 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1985  N-terminal truncated of elongation factor Ts  36.72 
 
 
207 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2270  UBA/TS-N domain-containing protein  31.78 
 
 
208 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2132  hypothetical protein  29.87 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2120  hypothetical protein  34.72 
 
 
109 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4272  hypothetical protein  30.61 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00290  UBA/TS-N domain-containing protein  25.38 
 
 
180 aa  45.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000331222 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1043  ubiquitin-associated- domain-containing protein  24.62 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2131  hypothetical protein  39.62 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593766  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1055  UBA/TS-N domain-containing protein  42.5 
 
 
182 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>