24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4021 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4021  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 123 aa  251  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.962383  normal  0.504594 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2227  preprotein translocase, SecE subunit  41.03 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0323574 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  35.38 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  35.38 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2113  preprotein translocase subunit SecE  29.6 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2365  preprotein translocase, SecE subunit  31.71 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2277  preprotein translocase, SecE subunit  31.71 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2202  preprotein translocase subunit SecE  40.35 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000618681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1586  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  31.71 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  43.64 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  30.43 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  41.82 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  46.67 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0519  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 68 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  44.9 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1705  preprotein translocase subunit SecE  44.19 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0347  preprotein translocase subunit SecE  44.19 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423362  normal  0.683866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0333  preprotein translocase subunit SecE  44.19 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.06103  normal  0.779327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  30 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  40.91 
 
 		 64 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>