21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3826 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3826  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0247874  normal  0.0380189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2825  hypothetical protein  95.43 
 
 
362 aa  584  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0929  hypothetical protein  41.5 
 
 
377 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0737  PEGA domain protein  40.57 
 
 
377 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1093  hypothetical protein  39.32 
 
 
324 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0572  hypothetical protein  36.67 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1192  hypothetical protein  37.29 
 
 
325 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150841  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4980  hypothetical protein  38.82 
 
 
359 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2168  hypothetical protein  37.04 
 
 
367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00211632  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4806  hypothetical protein  34.55 
 
 
369 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5303  hypothetical protein  29.81 
 
 
416 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2526  hypothetical protein  35.58 
 
 
391 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0371  hypothetical protein  27.3 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1423  hypothetical protein  28.95 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0883  hypothetical protein  33.59 
 
 
326 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.334814  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0498  hypothetical protein  31.68 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3789  PEGA domain protein  27.11 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3774  PEGA domain-containing protein  28.83 
 
 
317 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3648  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0366403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3877  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 
378 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3788  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 
360 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.10732  normal  0.21805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>