17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0929 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0737  PEGA domain protein  95.76 
 
 
377 aa  709    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0929  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  758    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4980  hypothetical protein  52.71 
 
 
359 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1093  hypothetical protein  41.94 
 
 
324 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1192  hypothetical protein  41.69 
 
 
325 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150841  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3826  hypothetical protein  41.5 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0247874  normal  0.0380189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2825  hypothetical protein  42.18 
 
 
362 aa  212  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0572  hypothetical protein  38.83 
 
 
373 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4806  hypothetical protein  37.95 
 
 
369 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2168  hypothetical protein  36.66 
 
 
367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00211632  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2526  hypothetical protein  34.82 
 
 
391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5303  hypothetical protein  31.17 
 
 
416 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0371  hypothetical protein  30.03 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0883  hypothetical protein  33.6 
 
 
326 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.334814  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1423  hypothetical protein  25.96 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1453  PEGA domain-containing protein  27.47 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0637995  normal  0.0741839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2682  serine/threonine protein kinase  33.73 
 
 
752 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>