17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1192 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1192  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  650    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150841  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1093  hypothetical protein  84 
 
 
324 aa  517  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0929  hypothetical protein  42.12 
 
 
377 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0737  PEGA domain protein  42.12 
 
 
377 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4980  hypothetical protein  43.33 
 
 
359 aa  212  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0572  hypothetical protein  35.45 
 
 
373 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2168  hypothetical protein  36.91 
 
 
367 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00211632  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3826  hypothetical protein  37.29 
 
 
330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0247874  normal  0.0380189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4806  hypothetical protein  33.05 
 
 
369 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2825  hypothetical protein  36.58 
 
 
362 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2526  hypothetical protein  37.97 
 
 
391 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5303  hypothetical protein  29.7 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0371  hypothetical protein  26.63 
 
 
357 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1423  hypothetical protein  28.23 
 
 
337 aa  89  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0363  hypothetical protein  30.59 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3774  PEGA domain-containing protein  26.67 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0883  hypothetical protein  30.77 
 
 
326 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.334814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>