15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0572 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0572  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  742    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0929  hypothetical protein  39.52 
 
 
377 aa  212  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0737  PEGA domain protein  42.12 
 
 
377 aa  209  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1093  hypothetical protein  37.97 
 
 
324 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4980  hypothetical protein  38.44 
 
 
359 aa  193  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2825  hypothetical protein  36.07 
 
 
362 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2168  hypothetical protein  38.28 
 
 
367 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00211632  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3826  hypothetical protein  36 
 
 
330 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0247874  normal  0.0380189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1192  hypothetical protein  36.39 
 
 
325 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150841  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4806  hypothetical protein  35.76 
 
 
369 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2526  hypothetical protein  34.8 
 
 
391 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5303  hypothetical protein  29.35 
 
 
416 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1423  hypothetical protein  28.67 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0371  hypothetical protein  29.39 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0883  hypothetical protein  35.35 
 
 
326 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.334814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>