191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1546 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1546  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
327 aa  664    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  32.2 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  31.25 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  29.86 
 
 
341 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  29.86 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  29.86 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0429  putative protein insertion permease FtsX  31.23 
 
 
344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  31.02 
 
 
344 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2751  cell division protein FtsX, putative  29.1 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0219043  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2371  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  hitchhiker  0.0000736942 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03714  cell division protein  30.48 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5335  cell division protein FtsX  29.59 
 
 
341 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420624  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4173  cell division protein FtsX  30.71 
 
 
338 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103974  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4326  hypothetical protein  28.52 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48080  Cell division protein FtsX  30.74 
 
 
335 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0869301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04920  cell division protein FtsX  29.52 
 
 
335 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123508  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0470  cell division protein FtsX  29.52 
 
 
335 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0214  cell division protein  28.37 
 
 
313 aa  116  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0407775  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0731  cell division protein FtsX  28.52 
 
 
299 aa  113  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  29.12 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2740  hypothetical protein  28.87 
 
 
302 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2901  cell division protein FtsX  27.46 
 
 
317 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00278  cell division protein  28.08 
 
 
322 aa  106  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2595  hypothetical protein  28.67 
 
 
309 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3716  cell division protein FtsX  30.24 
 
 
299 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.339466  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3978  hypothetical protein  29.1 
 
 
321 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000353238  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2722  hypothetical protein  28.33 
 
 
309 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2372  cell division protein FtsX  28.94 
 
 
330 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000210413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0277  hypothetical protein  28.28 
 
 
321 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000163126  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  25 
 
 
351 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2110  efflux ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
275 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3614  protein of unknown function DUF214  29.11 
 
 
298 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0221  hypothetical protein  28.52 
 
 
321 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.114522  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0625  cell division ABC transporter component permease protein FtsX  25.94 
 
 
328 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.910778  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  28.62 
 
 
321 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4584  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  27.18 
 
 
321 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002140  cell division protein FtsX  28.9 
 
 
322 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000746474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  25.56 
 
 
317 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  25.56 
 
 
317 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  25.56 
 
 
317 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  25.75 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0374  cell division protein FtsX  26.99 
 
 
308 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.377436  hitchhiker  0.00757237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  25.39 
 
 
351 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3970  cell division protein FtsX  26.85 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000192163  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  26.02 
 
 
351 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  25.39 
 
 
351 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  25.39 
 
 
351 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2303  hypothetical protein  29.23 
 
 
348 aa  97.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.826332  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  25.39 
 
 
351 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  25 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  25 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  25 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  25 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3772  cell division protein FtsX  26.17 
 
 
321 aa  96.7  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178624  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  25 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2243  cell division protein  28.32 
 
 
312 aa  96.7  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  25 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  25 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3845  cell division protein FtsX  26.17 
 
 
321 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000185349  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  25 
 
 
352 aa  95.9  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  25 
 
 
352 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2154  hypothetical protein  28.62 
 
 
312 aa  95.9  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.903191  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0173  hypothetical protein  26.85 
 
 
321 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000303587  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4092  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 
321 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420483  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3595  cell division protein FtsX  29.54 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00012744  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  25.09 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03535  cell division protein  26.26 
 
 
326 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0178612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4293  hypothetical protein  26.35 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4162  hypothetical protein  26.01 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000013492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3466  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  26.92 
 
 
321 aa  94.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.486455  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0203  hypothetical protein  28.05 
 
 
321 aa  93.6  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000250844  decreased coverage  0.00000260823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3503  hypothetical protein  26.57 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107838  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3604  hypothetical protein  26.85 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3672  protein of unknown function DUF214  28.2 
 
 
315 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  27.2 
 
 
324 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2661  cell division protein FtsX  30.92 
 
 
315 aa  89.7  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  24.52 
 
 
317 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3744  hypothetical protein  30.17 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  27.15 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  24.41 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0291  hypothetical protein  25.42 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000447855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4977  hypothetical protein  25.75 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5289  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  26.09 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5033  cell division ABC transporter permease FtsX  26.09 
 
 
297 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4863  cell division ABC transporter, permease  26.09 
 
 
297 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4878  cell division ABC transporter, permease  26.09 
 
 
297 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2477  cell division protein FtsX  28.03 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.680753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5271  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  26.09 
 
 
297 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5415  cell division ABC transporter permease protein FtsX  26.09 
 
 
297 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5346  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  26.09 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5301  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.75 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  27.18 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  24.4 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  23.79 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  24.5 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1859  cell division protein FtsX  24.28 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1278  cell division protein FtsX  24.39 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1760  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3722  hypothetical protein  25.08 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1100  cell division ABC transporter, permease  25.83 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>